粪菌移植后肠道菌群结构的重建程度是衡量其治疗效果的重要标准之一。高通量测序法等分子生物学技术可以对患儿粪菌移植治疗前后肠道菌群多样性、丰度以及主要优势菌群组成的变化进行全面分析。肠菌多样性指数分析可从整体水平评价肠菌多样性及肠菌平衡，丰度分析可比较特定菌群的相对丰度的变化。粪菌移植治疗后肠道中具有益生功效的菌群增殖增多，且有害菌减少，肠道菌群结构进一步恢复至正常水平；菌群移植后肠道的代谢产物的变化结合代谢组学方法分析结果进一步提示菌群结构的改善。上述结果证实粪菌移植治疗的有效，对治疗方案的完善、改良也起到重要作用。

临床+粪菌移植联合治疗的疗效标准参考临床症状和粪菌移植治疗前后患者肠道菌群变化情况制定相对统一、简便易行的疗效标准。疗效判定标准为：总有效率=治愈 + 显效 + 有效 / 总例数 ×100％。其中临床治愈是指患者在粪菌移植治疗后，临床腹泻症状完全缓解，经过1周粪菌移植治疗后，患者肠道菌群结构恢复正常；临床显效是指患者的腹泻等症状缓解，经1周粪菌移植治疗，其腹泻症状明显改善，同时患者肠道菌群多样性显著增加；临床无效是指患者的临床腹泻症状未缓解，或者出现恶化，治疗后患者肠道菌群结构未恢复正常，1周内粪菌移植有效率≥95.1％，常规治疗+临床+粪菌移植治疗2周后粪菌移植有效率高于对照组。

综上所述，对于抗生素相关性腹泻患儿肠道菌群失衡，粪菌移植作为一种新方法已在临床得到应用，并显示出良好的治疗效果。粪菌移植通过将健康捐菌者的有益菌群输送到患者体内，有利于恢复患者肠道微生态失衡，进而改善腹泻、修复肠道微生态平衡等。粪菌移植治疗难治性复发性抗生素相关性腹泻的有效率高于万古霉素，有效率明显增高。同时，目前的相关研究显示，粪菌移植用于患儿的短期安全性较好，且随访未发现严重不良反应。

出自《抗生素相关性腹泻患儿肠道菌群紊乱与粪菌移植治疗的疗效评估》作者李冰。