小肠是对食物消化加营养吸收的主要场所，其微生物数量相对较少，且以需氧菌和兼性厌氧菌为主，每克小肠内容物含数千到数亿个细胞。结肠是肠道微生物的主要栖息地，结肠作为人体微生物群最密集的栖息地，其厌氧环境更利于来自供体粪便的厌氧有益菌的存活与定植，每克结肠内容物可含高达1000亿个微生物细胞，且以厌氧菌为主。由于结肠中的微生物数量庞大且种类丰富，且粪便是在结肠中最终形成并排出体外的，粪便中的微生物绝大多数来源于结肠。

有研究关于15名帕金森病患者的粪便菌群移植治疗的对比发现，通过短期和长期观察，结肠镜进行的下消化道粪便菌群移植，其疗效均优于通过鼻肠管进行的上消化道粪便菌群移植，并且维持疗效的时间更长，这一发现与粪便肠道微生物在人体主要存活位置结肠相一致。此外，动物模型研究也支持了直接靶向下消化道的原理机制。有研究证实，在阿尔茨海默病小鼠模型中来自健康供体的粪便菌群移植能减少大脑淀粉样蛋白沉积和tau蛋白磷酸化和有效改善认知功能。但这些临床前研究大部分采用灌胃方式，它们的成功依赖于对肠道的抗生素预处理，抗生素预处理能清空原有有益有害菌，为移植菌群定植提供良好的定值繁殖环境。

粪便菌群移植的给药效果会随着时间的推移而减弱，受体本身自有的菌群可能逐渐恢复活力并在数量少重新占据主要数量，供体菌群的比例下降，从而削弱粪便菌群移植的效果。研究报道了在给药频率上初期高频或持久多次的粪便菌群移植强化方案，在疗效的持久效果上显著优于单次或低频方案。在AD动物模型中也有相关验证，如在5×FAD小鼠实验中每隔一天进行一次FMT，持续8周能够有效改善认知障碍并减少Aβ病理，而每周一次的同等周期FMT方案则未能产生显著的认知和病理改善。

出自《粪菌移植治疗阿尔茨海默病研究进展》作者陈梦梦，李金芮，于俊梅。