移植前的抗生素使用、饮食改变和肠道炎症都会影响肠道菌群组成。移植物抗宿主病导致肠道菌群多样性降低，特别是产生短链脂肪酸和吲哚的有益菌减少。其中包括拟杆菌属、普氏菌属、乳酸杆菌属和梭状芽孢杆菌群等重要厌氧菌，它们在维持免疫稳态、调节上皮细胞功能以及防止致病菌定植方面具有重要作用。移植物抗宿主病引起的肠上皮损伤与炎症导致这些有益菌大幅下降，使得菌群逐步被肠杆菌科等条件致病菌占据，进一步加剧黏膜损伤和免疫异常。菌群多样性的丧失已被视作移植物抗宿主病严重程度和预后不良的重要预测指标。这些菌群代谢产物对维持肠道免疫稳态至关重要，其减少会加剧移植物抗宿主病。

研究还发现，肠道菌群通过调节IL-12/23p40的产生影响肠道上皮细胞MHCⅡ类分子的表达，从而参与移植物抗宿主病的起始。具体而言，菌群组成的变化可驱动固有免疫细胞，尤其是巨噬细胞和树突状细胞，分泌IL-12/23p40亚基，而这一亚基是Th1和Th17免疫反应的核心调节因子。同时，IL-12/23p40可诱导肠上皮细胞表达MHCⅡ类分子，使上皮细胞不仅是结构细胞，也成为抗原呈递细胞，从而直接参与供体T细胞的激活过程。这一发现提示菌群不仅在移植物抗宿主病进展中起作用，也可能参与早期免疫启动阶段。

研究发现，肠道微生物群中脆弱拟杆菌的丰富度与移植物抗宿主病的严重程度呈负相关，采用脆弱拟杆菌或粪便微生物移植可能给异基因造血干细胞移植受者提供一个有利的微生物环境，从而减轻移植物抗宿主病的发展。研究证明移植前后口服鼠李糖乳杆菌GG可提高生存率，减少急性移植物抗宿主病的发生，并减轻肠道菌群的易位。

出自《胃肠道移植物抗宿主病的研究进展》作者胡楠，智发朝。